违法拆迁中损失的计算方式如下：首先是房屋价值损失。应通过专业评估机构，依据房屋的区位、用途、建筑面积等因素，按照市场比较法、收益法等合理的评估方法来确定其市场价值，以此作为房屋价值损失的依据。其次是装修及附属设施损失。可根据装修及附属设施的实际造价，并结合成新率来计算。实际造价可参考装修及附属设施建造时的相关票据等资料，成新率则依据其使用年限、损坏程度等综合判定。再者是搬迁、临时安置补偿损失。搬迁费按照实际发生的合理费用计算，如搬运物品所需的人工费用等。临时安置费根据当地的相关标准，结合过渡期限来确定，以保障被拆迁人在临时安置期间的基本居住需求。另外，对于因违法拆迁导致的停产停业损失，若被拆迁房屋用于经营，应根据房屋被征收前的效益、停产停业期限等因素来计算。效益可通过纳税记录、经营流水等进行综合评估。总之，需全面、合理地计算各项损失，以维护被拆迁人的合法权益。

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