农村对房屋进行三层改造是否违法需视具体情况而定。首先，需明确是否取得合法的审批手续。若未经相关部门批准，擅自对房屋进行三层改造，改变房屋原有规划设计，可能违反城乡规划法等相关法律法规。在进行房屋改造前，应向当地城乡规划主管部门或相关审批机构提出申请，提交房屋改造的设计方案、用途等资料，经审核批准后方可实施改造。若已取得合法审批，按照批准的内容进行三层改造，则不违法。合法的审批是确保改造行为合规的关键依据。此外，还需关注改造过程中是否符合建筑安全标准，包括结构安全、消防安全等方面要求。改造后的房屋应具备相应的安全性和稳定性，以保障居住者及周边人员的生命财产安全。总之，农村三楼改三层本身不一定违法，关键在于是否依法依规履行相关审批及符合安全标准等要求。

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