占用国家土地建房的处理方式如下：首先，相关部门会责令退还非法占用的土地。若该土地符合土地利用总体规划，责令限期拆除在非法占用土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状；若不符合土地利用总体规划，则没收在非法占用土地上新建的建筑物和其他设施。其次，可并处罚款。罚款标准依据《土地管理法》等相关法律法规确定。再者，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予处分；构成犯罪的，依法追究刑事责任。比如，可能触犯非法占用农用地罪等罪名。此外，若建房者拒不执行相关处罚决定，相关部门可依法申请人民法院强制执行，以确保法律的严肃性和土地管理秩序。总之，任何单位或个人都应严格遵守土地管理法律法规，不得擅自占用国家土地建房，否则必将受到法律的制裁。

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